MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT11

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020250	GATA	2	8	6	13	50 %	25 %	25 %	0 %	449092688
2	NC_020250	TTG	2	6	154	159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092688
3	NC_020250	GAT	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092688
4	NC_020250	TTG	2	6	219	224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092689
5	NC_020250	ATTA	2	8	257	264	50 %	50 %	0 %	0 %	449092689
6	NC_020250	GATA	2	8	297	304	50 %	25 %	25 %	0 %	449092689
7	NC_020250	ATGA	2	8	305	312	50 %	25 %	25 %	0 %	449092689
8	NC_020250	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092690
9	NC_020250	TTC	2	6	341	346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092690
10	NC_020250	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092690
11	NC_020250	TAA	2	6	402	407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092690
12	NC_020250	CAC	2	6	415	420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092690
13	NC_020250	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092691
14	NC_020250	ATTT	2	8	516	523	25 %	75 %	0 %	0 %	449092691
15	NC_020250	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092691
16	NC_020250	ACA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092691
17	NC_020250	CAA	2	6	657	662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092692
18	NC_020250	TTTG	2	8	682	689	0 %	75 %	25 %	0 %	449092692
19	NC_020250	TGA	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092692
20	NC_020250	ATTA	2	8	745	752	50 %	50 %	0 %	0 %	449092692
21	NC_020250	ATTT	2	8	759	766	25 %	75 %	0 %	0 %	449092693
22	NC_020250	TAT	2	6	849	854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092693
23	NC_020250	ATC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092693
24	NC_020250	T	7	7	1050	1056	0 %	100 %	0 %	0 %	449092694
25	NC_020250	GGTA	2	8	1120	1127	25 %	25 %	50 %	0 %	449092694
26	NC_020250	AAT	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092694
27	NC_020250	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092694
28	NC_020250	TA	3	6	1209	1214	50 %	50 %	0 %	0 %	449092694
29	NC_020250	A	7	7	1296	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	449092694
30	NC_020250	CGGTGG	2	12	1411	1422	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	449092694
31	NC_020250	TAC	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092694
32	NC_020250	ATA	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092694
33	NC_020250	A	6	6	1542	1547	100 %	0 %	0 %	0 %	449092694
34	NC_020250	GAT	2	6	1553	1558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092694
35	NC_020250	AGA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
36	NC_020250	TAA	2	6	1600	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092694
37	NC_020250	ACC	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092694
38	NC_020250	TGG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092694
39	NC_020250	GGT	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092694
40	NC_020250	AAG	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
41	NC_020250	AAC	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092694
42	NC_020250	ACAA	2	8	1920	1927	75 %	0 %	0 %	25 %	449092694
43	NC_020250	ACC	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092694
44	NC_020250	G	6	6	2001	2006	0 %	0 %	100 %	0 %	449092694
45	NC_020250	TAAAGA	2	12	2014	2025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449092694
46	NC_020250	AGAA	2	8	2031	2038	75 %	0 %	25 %	0 %	449092694
47	NC_020250	GAA	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
48	NC_020250	AGA	2	6	2071	2076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
49	NC_020250	GGGA	2	8	2310	2317	25 %	0 %	75 %	0 %	449092694
50	NC_020250	A	6	6	2324	2329	100 %	0 %	0 %	0 %	449092694
51	NC_020250	GAA	2	6	2369	2374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
52	NC_020250	TTG	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092694
53	NC_020250	T	6	6	2443	2448	0 %	100 %	0 %	0 %	449092695
54	NC_020250	TAG	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092695
55	NC_020250	TTTG	2	8	2475	2482	0 %	75 %	25 %	0 %	449092695
56	NC_020250	AT	3	6	2559	2564	50 %	50 %	0 %	0 %	449092695
57	NC_020250	GGTTTA	2	12	2657	2668	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	449092695
58	NC_020250	TGG	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092695
59	NC_020250	GGAT	2	8	2693	2700	25 %	25 %	50 %	0 %	449092695
60	NC_020250	A	7	7	2791	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	449092695
61	NC_020250	ATT	2	6	2825	2830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092695
62	NC_020250	TCC	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449092695
63	NC_020250	TGCT	2	8	2987	2994	0 %	50 %	25 %	25 %	449092695
64	NC_020250	AGA	2	6	3006	3011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092695
65	NC_020250	AAT	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092695
66	NC_020250	TGA	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092695
67	NC_020250	TTG	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
68	NC_020250	TA	3	6	3311	3316	50 %	50 %	0 %	0 %	449092695
69	NC_020250	GAA	2	6	3369	3374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092695
70	NC_020250	TGA	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092695
71	NC_020250	TGT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
72	NC_020250	TTG	2	6	3794	3799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
73	NC_020250	GTT	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
74	NC_020250	AGGT	2	8	3826	3833	25 %	25 %	50 %	0 %	449092695
75	NC_020250	TAT	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092696
76	NC_020250	TGG	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092696
77	NC_020250	ATG	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092696
78	NC_020250	T	6	6	4067	4072	0 %	100 %	0 %	0 %	449092697
79	NC_020250	T	6	6	4100	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	449092697
80	NC_020250	GTA	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092697
81	NC_020250	ATT	2	6	4163	4168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092697
82	NC_020250	TGG	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092697
83	NC_020250	AT	3	6	4306	4311	50 %	50 %	0 %	0 %	449092697
84	NC_020250	TTAC	2	8	4326	4333	25 %	50 %	0 %	25 %	449092697
85	NC_020250	TTGT	2	8	4371	4378	0 %	75 %	25 %	0 %	449092697
86	NC_020250	GGT	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092697
87	NC_020250	CAT	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092697
88	NC_020250	AATG	2	8	4417	4424	50 %	25 %	25 %	0 %	449092697
89	NC_020250	TTGG	2	8	4455	4462	0 %	50 %	50 %	0 %	449092698
90	NC_020250	TTAT	2	8	4549	4556	25 %	75 %	0 %	0 %	449092698
91	NC_020250	ACG	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092698
92	NC_020250	TGTT	2	8	4609	4616	0 %	75 %	25 %	0 %	449092698
93	NC_020250	CAT	3	9	4618	4626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092698
94	NC_020250	AGT	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092698
95	NC_020250	TTAT	2	8	4640	4647	25 %	75 %	0 %	0 %	449092698
96	NC_020250	TGG	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092698
97	NC_020250	TTA	2	6	4708	4713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092699
98	NC_020250	T	6	6	4717	4722	0 %	100 %	0 %	0 %	449092699
99	NC_020250	GTT	2	6	4729	4734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092699
100	NC_020250	AGA	2	6	4776	4781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092699
101	NC_020250	AAAAC	2	10	5108	5117	80 %	0 %	0 %	20 %	449092700
102	NC_020250	ATT	2	6	5156	5161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092700
103	NC_020250	AGA	2	6	5164	5169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092700
104	NC_020250	GAAT	2	8	5248	5255	50 %	25 %	25 %	0 %	449092700
105	NC_020250	TGA	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092700
106	NC_020250	CGT	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092700
107	NC_020250	TTTTGA	2	12	5374	5385	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449092700
108	NC_020250	GAA	2	6	5392	5397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092700
109	NC_020250	ATT	2	6	5408	5413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092700
110	NC_020250	ATT	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092700
111	NC_020250	GCTA	2	8	5443	5450	25 %	25 %	25 %	25 %	449092700
112	NC_020250	AAT	2	6	5457	5462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092700
113	NC_020250	AGA	3	9	5510	5518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092701
114	NC_020250	AAACG	2	10	5525	5534	60 %	0 %	20 %	20 %	449092701
115	NC_020250	A	6	6	5565	5570	100 %	0 %	0 %	0 %	449092701
116	NC_020250	ACA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092701
117	NC_020250	TA	3	6	5647	5652	50 %	50 %	0 %	0 %	449092701
118	NC_020250	AGA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092701
119	NC_020250	GTT	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092701
120	NC_020250	GTTT	2	8	5889	5896	0 %	75 %	25 %	0 %	449092702
121	NC_020250	GAA	2	6	5909	5914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092702
122	NC_020250	TTA	2	6	6097	6102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092702
123	NC_020250	GTT	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092702
124	NC_020250	CAT	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092702
125	NC_020250	TGA	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092702
126	NC_020250	TTA	2	6	6220	6225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092702
127	NC_020250	ATG	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092702
128	NC_020250	AGA	2	6	6279	6284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092702
129	NC_020250	CCG	2	6	6396	6401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449092702
130	NC_020250	AGA	2	6	6520	6525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092703
131	NC_020250	A	6	6	6525	6530	100 %	0 %	0 %	0 %	449092703
132	NC_020250	AGA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092703
133	NC_020250	AATA	2	8	6551	6558	75 %	25 %	0 %	0 %	449092703
134	NC_020250	GA	3	6	6575	6580	50 %	0 %	50 %	0 %	449092703
135	NC_020250	GAA	3	9	6618	6626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092703
136	NC_020250	A	6	6	6629	6634	100 %	0 %	0 %	0 %	449092703
137	NC_020250	CAT	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092703
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.